Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx4Q9QY61 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms