Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nphp1Q9QY53 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nphp1Q9QY53 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms