Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cyth1Q9QX11 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms