Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cln8Q9QUK3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cln8Q9QUK3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cln8Q9QUK3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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