Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SacsQ9JLC8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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