Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Irx5Q9JKQ4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Irx5Q9JKQ4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms