Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms