Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Bco1Q9JJS6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Bco1Q9JJS6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bco1Q9JJS6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bco1Q9JJS6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Bco1Q9JJS6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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