Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1Q9JIT0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms