Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms