Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp29Q9ES63 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp29Q9ES63 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Usp29Q9ES63 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp29Q9ES63 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp29Q9ES63 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp29Q9ES63 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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