Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clstn2Q9ER65 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clstn2Q9ER65 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms