Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms