Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQN3

Tsc22d4, TSC22 domain family protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d4Q9EQN3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tsc22d4Q9EQN3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tsc22d4Q9EQN3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms