Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms