Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms