Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf4Q9DAW6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpf4Q9DAW6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms