Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem239Q9DA47 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Tmem239Q9DA47 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Tmem239Q9DA47 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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