Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DA42 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DA42 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DA42 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DA42 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms