Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Calr3Q9D9Q6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms