Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Actrt2Q9D9L5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms