Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Snx5Q9D8U8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx5Q9D8U8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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