Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rexo2Q9D8S4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms