Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Q9D8Q6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Q9D8Q6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Q9D8Q6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Q9D8Q6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Q9D8Q6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Q9D8Q6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9D8Q6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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