Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fip1l1Q9D824 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms