Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms