Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf13Q9D777 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tnfsf13Q9D777 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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