Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sf3a3Q9D554 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms