Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms