Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Efhd1Q9D4J1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms