Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syce1Q9D495 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms