Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933425L06RikQ9D3Z8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms