Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Spns3Q9D232 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms