Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms