Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rnf146Q9CZW6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rnf146Q9CZW6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rnf146Q9CZW6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf146Q9CZW6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf146Q9CZW6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf146Q9CZW6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf146Q9CZW6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf146Q9CZW6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf146Q9CZW6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms