Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcbQ9CXT8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms