Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Xrcc3Q9CXE6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Xrcc3Q9CXE6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Xrcc3Q9CXE6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Xrcc3Q9CXE6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Xrcc3Q9CXE6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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