Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RpainQ9CWY9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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RpainQ9CWY9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RpainQ9CWY9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms