Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dis3Q9CSH3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dis3Q9CSH3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms