Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prps2Q9CS42 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms