Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tm4sf20Q9CQY8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tm4sf20Q9CQY8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tm4sf20Q9CQY8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tm4sf20Q9CQY8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Tm4sf20Q9CQY8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tm4sf20Q9CQY8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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