Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Chchd5Q9CQP3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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