Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb5Q9CQH3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms