Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed6Q9CQG0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms