Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Commd4Q9CQ02 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Commd4Q9CQ02 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms