Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ssxb1Q9CPU1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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