Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl17Q9CPR4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl17Q9CPR4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms