Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prpf8Q99PV0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms