Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim8Q99PJ2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim8Q99PJ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms