Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrrtQ99MR6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms